20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1572 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  44.62 
 
 
185 aa  154  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4084  hypothetical protein  41.08 
 
 
184 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1613  protein of unknown function DUF721  43.72 
 
 
190 aa  140  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  43.24 
 
 
185 aa  129  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  38.71 
 
 
178 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0796  hypothetical protein  35.5 
 
 
181 aa  75.9  3e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  22.15 
 
 
300 aa  50.1  2e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  26.29 
 
 
188 aa  45.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  28.77 
 
 
160 aa  45.1  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  25.88 
 
 
173 aa  45.1  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  22.97 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  25.81 
 
 
287 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  34.92 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04871  hypothetical protein  20 
 
 
161 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0908407  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  22.73 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  26.92 
 
 
201 aa  41.6  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04561  hypothetical protein  19.41 
 
 
153 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>