23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1483 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  61.49 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3816  hypothetical protein  51.81 
 
 
170 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3866  hypothetical protein  51.81 
 
 
170 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2957  hypothetical protein  49.7 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000744507  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  45.24 
 
 
171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  47.56 
 
 
169 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  35.37 
 
 
168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  34.76 
 
 
167 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  33.13 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  32.3 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  28.89 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1183  hypothetical protein  35.37 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  31.29 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3638  hypothetical protein  28.02 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0190934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0139  hypothetical protein  33.75 
 
 
204 aa  84.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0098  hypothetical protein  26.63 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  25.16 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  27.74 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  25.64 
 
 
657 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  28.39 
 
 
245 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3282  hypothetical protein  23.03 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>