21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0139 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0139  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3638  hypothetical protein  43.51 
 
 		 178 aa  131  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0190934  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  42.67 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  37.58 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  38.93 
 
 		 169 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  40.25 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  31.01 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1183  hypothetical protein  36.67 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  33.75 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  33.1 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  30.38 
 
 		 163 aa  89.4  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2957  hypothetical protein  32.5 
 
 		 175 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000744507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  31.65 
 
 		 166 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3816  hypothetical protein  31.51 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3866  hypothetical protein  31.51 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0098  hypothetical protein  30.63 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  32.67 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  28.1 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  28.15 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  45 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>