58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1487 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1487  nitroreductase  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2978  nitroreductase  95.48 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2455  nitroreductase  75.88 
 
 		 199 aa  301  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30800  hypothetical protein  67.17 
 
 		 200 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0987437  hitchhiker  0.000000000186465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2641  hypothetical protein  66.67 
 
 		 200 aa  289  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.868545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3529  hypothetical protein  62.63 
 
 		 199 aa  262  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0433  hypothetical protein  62.12 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0497  hypothetical protein  62.12 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0369  nitroreductase family protein  55.28 
 
 		 199 aa  246  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2057  hypothetical protein  54.27 
 
 		 200 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00270111  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5017  hypothetical protein  58.25 
 
 		 195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.998448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3371  hypothetical protein  53.77 
 
 		 200 aa  242  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154026  hitchhiker  4.547470000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1819  nitroreductase  53.27 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000197539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2035  hypothetical protein  53.77 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1768  nitroreductase family protein  54.27 
 
 		 199 aa  241  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000036137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1986  hypothetical protein  54.27 
 
 		 200 aa  240  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10438e-46 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1957  hypothetical protein  53.27 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0981647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1785  nitroreductase family protein  53.77 
 
 		 199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000192884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1811  hypothetical protein  53.77 
 
 		 199 aa  237  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0479853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1951  hypothetical protein  53.77 
 
 		 199 aa  237  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336055  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2305  oxidoreductase related to nitroreductase-like protein  55.22 
 
 		 203 aa  235  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000723605  normal  0.0201915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2105  hypothetical protein  60.41 
 
 		 212 aa  234  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2494  nitroreductase  50.75 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.778298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3099  nitroreductase family protein  50.25 
 
 		 199 aa  227  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3410  hypothetical protein  50.25 
 
 		 199 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3172  nitroreductase family protein  50.25 
 
 		 199 aa  226  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000372111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3400  hypothetical protein  50.25 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1545  hypothetical protein  51.27 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.090911  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1745  oxidoreductase  52.04 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.573968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3421  hypothetical protein  49.75 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1777  hypothetical protein  51.81 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.482837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3444  hypothetical protein  49.25 
 
 		 199 aa  221  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3191  hypothetical protein  49.25 
 
 		 199 aa  221  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0278  putative nitroreductase family protein  50.25 
 
 		 199 aa  219  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1909  nitroreductase family protein  50.99 
 
 		 204 aa  214  7e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1017  nitroreductase  49.49 
 
 		 199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2184  oxidoreductase  53.96 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1877  nitroreductase-like oxidoreductase  50.75 
 
 		 200 aa  207  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1116  nitroreductase family protein  46.7 
 
 		 201 aa  204  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169021  normal  0.724836 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1319  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000492984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2070  hypothetical protein  46.7 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000267475  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2107  hypothetical protein  46.7 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00257983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2908  nitroreductase  46.7 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000982671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3613  nitroreductase  43.94 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0720583  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02343  nitroreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09910)  43.96 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1793  nitroreductase  43.75 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1923  hypothetical protein  43.23 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.89424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1919  hypothetical protein  43.23 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0270589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1955  hypothetical protein  43.23 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000305608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1738  nitroreductase family protein  43.23 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.137703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1781  hypothetical protein  43.23 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2003  hypothetical protein  43.23 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.453289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3420  hypothetical protein  42.71 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1760  nitroreductase family protein  43.23 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2024  hypothetical protein  42.71 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000571898  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01853  conserved hypothetical protein  38.42 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01800  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02030  nitroreductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03530)  30.22 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485977  normal  0.398341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>