44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  91.39 
 
 
210 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  69.61 
 
 
214 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  62.93 
 
 
216 aa  284  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  62.69 
 
 
223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  59.72 
 
 
225 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  62.44 
 
 
216 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  61.93 
 
 
216 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  57.62 
 
 
223 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  56.67 
 
 
223 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  60.62 
 
 
216 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  46.6 
 
 
223 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  29.83 
 
 
214 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
212 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
212 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
215 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
215 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 
212 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  27.37 
 
 
212 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
212 aa  92  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  26.2 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  27.51 
 
 
209 aa  88.6  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  44.93 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  19.29 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8961  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  27.47 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
142 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.290046  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
180 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
156 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.87 
 
 
157 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
143 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0154412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>