34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2477 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  460  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  96.83 
 
 		 223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  73.3 
 
 		 216 aa  327  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  67.3 
 
 		 214 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  62.25 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  62.25 
 
 		 225 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  59.43 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  61.88 
 
 		 216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  57.87 
 
 		 216 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  59.81 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  57.62 
 
 		 237 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  33.51 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  34.57 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  31.96 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  31.79 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  30.81 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.89 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  30.89 
 
 		 215 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 		 216 aa  95.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  26.01 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>