22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03171 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  330  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  60.39 
 
 
158 aa  175  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  61.64 
 
 
146 aa  173  1e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  34.13 
 
 
171 aa  72  4e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  34.13 
 
 
171 aa  72  4e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  29.6 
 
 
197 aa  65.5  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  29.6 
 
 
197 aa  65.5  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  27.69 
 
 
169 aa  63.9  9e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  25.62 
 
 
160 aa  63.2  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  29.69 
 
 
190 aa  62.8  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  34.31 
 
 
197 aa  63.2  2e-09  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.62 
 
 
160 aa  63.2  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  29.69 
 
 
190 aa  62.8  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  29.03 
 
 
184 aa  60.5  9e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.45 
 
 
186 aa  59.7  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.66 
 
 
172 aa  57.4  1e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  28.57 
 
 
174 aa  54.3  7e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  30.71 
 
 
165 aa  53.9  9e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  23.97 
 
 
175 aa  53.9  1e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  30.09 
 
 
175 aa  53.1  2e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  32.14 
 
 
133 aa  52  3e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  31.15 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.596766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>