More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0839 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
952 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  63.95 
 
 
802 aa  1125    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
819 aa  778    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
813 aa  734    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
824 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
868 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
904 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 
858 aa  914    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  64.49 
 
 
804 aa  1138    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
819 aa  697    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  49.6 
 
 
879 aa  833    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  64.57 
 
 
802 aa  1137    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
863 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  61.68 
 
 
833 aa  1073    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
859 aa  666    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 
802 aa  1136    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
802 aa  1135    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  64.57 
 
 
802 aa  1136    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
801 aa  820    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
802 aa  1135    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
971 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
823 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
823 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
820 aa  653    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
906 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
830 aa  693    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
814 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 
807 aa  833    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
813 aa  736    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
872 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
954 aa  732    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
819 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
838 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
823 aa  712    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
851 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
860 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
805 aa  894    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
884 aa  641    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
805 aa  885    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
860 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
824 aa  702    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
829 aa  704    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
877 aa  655    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
802 aa  1135    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
904 aa  673    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
865 aa  686    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 
805 aa  1087    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
804 aa  868    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 
805 aa  1087    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
829 aa  763    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
827 aa  748    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
858 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
906 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
824 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
828 aa  721    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
819 aa  663    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
817 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3443  leucyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
855 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
824 aa  737    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
872 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
820 aa  652    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
817 aa  673    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
969 aa  717    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
815 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
856 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
819 aa  686    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
865 aa  669    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
971 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
817 aa  701    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
870 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
816 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
816 aa  714    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
860 aa  658    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
949 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
860 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 
859 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
868 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
872 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
824 aa  773    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  44 
 
 
829 aa  709    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
863 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  67.16 
 
 
806 aa  1167    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 
829 aa  1063    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
829 aa  1721    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  64.9 
 
 
804 aa  1087    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  74.17 
 
 
808 aa  1299    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  62.75 
 
 
833 aa  1090    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
843 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
825 aa  765    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
1016 aa  715    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
816 aa  711    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 
859 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
832 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
823 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
816 aa  848    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1884  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
848 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.439942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
864 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
971 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
859 aa  648    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
968 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>