25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1792 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1792  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  233  9e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.000000000573078  normal  0.10017 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1776  hypothetical protein  73.28 
 
 
116 aa  180  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4346  hypothetical protein  57.02 
 
 
116 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1692  hypothetical protein  59.46 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0217  hypothetical protein  41.23 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1012  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.12519  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1324  putative exported protein of unknown function  40.57 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903845  normal  0.229957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0167  hypothetical protein  39.6 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537871  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0702  hypothetical protein  39.22 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6223  hypothetical protein  35.59 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0760  hypothetical protein  37.86 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0363  hypothetical protein  32.48 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0218  hypothetical protein  40.43 
 
 
126 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0439121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0450  hypothetical protein  36.96 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0042  hypothetical protein  39.13 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7083  hypothetical protein  33.02 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.200411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5426  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4462  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3136  hypothetical protein  31.96 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2346  hypothetical protein  34.69 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2389  hypothetical protein  34.69 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2666  hypothetical protein  34.69 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0838  hypothetical protein  31.45 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4822  hypothetical protein  29.17 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4730  hypothetical protein  33.98 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>