26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0760 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0760  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  246  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1012  hypothetical protein  99.21 
 
 
126 aa  244  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.12519  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1324  putative exported protein of unknown function  86.51 
 
 
126 aa  202  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903845  normal  0.229957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6223  hypothetical protein  58.33 
 
 
134 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7083  hypothetical protein  53.1 
 
 
131 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.200411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0838  hypothetical protein  50.76 
 
 
129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0217  hypothetical protein  39.47 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4462  hypothetical protein  43.56 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1792  hypothetical protein  39.66 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.000000000573078  normal  0.10017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0218  hypothetical protein  44.44 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0439121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5426  hypothetical protein  42.42 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4346  hypothetical protein  41.44 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3136  hypothetical protein  39.8 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1776  hypothetical protein  36.21 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1692  hypothetical protein  35.96 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0702  hypothetical protein  34.86 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0167  hypothetical protein  41.58 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537871  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0363  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0042  hypothetical protein  40.38 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4822  hypothetical protein  32.35 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2389  hypothetical protein  35.64 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2666  hypothetical protein  35.64 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2346  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4730  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0450  hypothetical protein  36.27 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3500  hypothetical protein  37 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>