26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1324 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1324  putative exported protein of unknown function  100 
 
 
126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903845  normal  0.229957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1012  hypothetical protein  85.71 
 
 
126 aa  216  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.12519  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0760  hypothetical protein  87.04 
 
 
126 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6223  hypothetical protein  56.59 
 
 
134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0838  hypothetical protein  50.76 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7083  hypothetical protein  52.21 
 
 
131 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.200411  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0218  hypothetical protein  46.39 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0439121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5426  hypothetical protein  44.33 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0217  hypothetical protein  39.47 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1792  hypothetical protein  39.66 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.000000000573078  normal  0.10017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4462  hypothetical protein  38.66 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3136  hypothetical protein  41.84 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4346  hypothetical protein  42.34 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1776  hypothetical protein  37.07 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0042  hypothetical protein  38.24 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0167  hypothetical protein  36.36 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537871  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1692  hypothetical protein  37.11 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0702  hypothetical protein  29.84 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0363  hypothetical protein  32.17 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4822  hypothetical protein  34.91 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4730  hypothetical protein  35.51 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2389  hypothetical protein  33 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2666  hypothetical protein  33 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2346  hypothetical protein  32.32 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0450  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3500  hypothetical protein  35 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>