24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4462 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4462  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  233  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6223  hypothetical protein  42.86 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0218  hypothetical protein  43.43 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0439121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5426  hypothetical protein  44.33 
 
 
126 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1012  hypothetical protein  43.56 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.12519  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0760  hypothetical protein  43.43 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1324  putative exported protein of unknown function  41.58 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903845  normal  0.229957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7083  hypothetical protein  43.43 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.200411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0838  hypothetical protein  37.1 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0217  hypothetical protein  38.71 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1692  hypothetical protein  36.89 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1776  hypothetical protein  35.25 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3136  hypothetical protein  38.33 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4730  hypothetical protein  35.35 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2389  hypothetical protein  39.8 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2666  hypothetical protein  39.8 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4822  hypothetical protein  37.76 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2346  hypothetical protein  37.76 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0702  hypothetical protein  31.71 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594351  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1792  hypothetical protein  31.97 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.000000000573078  normal  0.10017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4346  hypothetical protein  32.79 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0363  hypothetical protein  27.42 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0042  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0167  hypothetical protein  34 
 
 
141 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>