25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5426 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5426  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  246  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0218  hypothetical protein  87.3 
 
 
126 aa  206  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0439121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3136  hypothetical protein  62.89 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2666  hypothetical protein  51.2 
 
 
130 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2389  hypothetical protein  51.2 
 
 
130 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2346  hypothetical protein  54.95 
 
 
130 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4462  hypothetical protein  41.23 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1324  putative exported protein of unknown function  44.33 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903845  normal  0.229957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0838  hypothetical protein  41.13 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1012  hypothetical protein  40.5 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.12519  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7083  hypothetical protein  36.28 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.200411  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0760  hypothetical protein  42.42 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6223  hypothetical protein  36.04 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1776  hypothetical protein  36 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0217  hypothetical protein  42.55 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0702  hypothetical protein  33.6 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594351  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1792  hypothetical protein  36.75 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.000000000573078  normal  0.10017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1692  hypothetical protein  36.8 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4730  hypothetical protein  31 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4822  hypothetical protein  35.09 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4346  hypothetical protein  33.06 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0363  hypothetical protein  29.79 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0167  hypothetical protein  37.96 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537871  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0042  hypothetical protein  37.96 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0450  hypothetical protein  33.62 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>