More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0076 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0076  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  223  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0461291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  91.96 
 
 
112 aa  211  2e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 
112 aa  203  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  87.5 
 
 
112 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  198  2e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  196  8e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  83.93 
 
 
112 aa  195  2e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
116 aa  195  2e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
116 aa  195  2e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  79.46 
 
 
116 aa  188  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  187  3e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  184  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75.89 
 
 
112 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  182  1e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  181  2e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  181  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  180  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  180  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 
112 aa  179  9e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75 
 
 
112 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
136 aa  178  3e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  177  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  177  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  74.11 
 
 
112 aa  174  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  174  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
136 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  173  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  173  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  172  1e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3050  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  172  2e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  69.64 
 
 
112 aa  171  3e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 
112 aa  170  7e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  170  7e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 
112 aa  170  7e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0555  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  169  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  169  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  167  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  168  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  167  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  167  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  69.64 
 
 
112 aa  167  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  166  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 
112 aa  166  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  165  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  7.17962e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  165  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  164  3e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  164  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  164  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  164  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  163  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  163  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  163  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>