More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3146 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
120 aa  247  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75.83 
 
 
120 aa  188  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75 
 
 
119 aa  187  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  74.17 
 
 
120 aa  186  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75 
 
 
121 aa  185  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  73.11 
 
 
120 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  74.79 
 
 
119 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.27 
 
 
120 aa  179  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  73.33 
 
 
115 aa  178  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  69.23 
 
 
133 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2218  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  74.77 
 
 
129 aa  176  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0238312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1955  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  77.36 
 
 
128 aa  176  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000220764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  73.5 
 
 
118 aa  176  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  decreased coverage  0.00532589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  71.68 
 
 
117 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  76.64 
 
 
122 aa  174  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  73.21 
 
 
116 aa  173  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  69.49 
 
 
117 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12230  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75.47 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.40084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  81.37 
 
 
115 aa  172  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  73.21 
 
 
116 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  66.67 
 
 
116 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.17 
 
 
118 aa  169  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70.54 
 
 
116 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3313  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.33 
 
 
120 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3302  HesB/YadR/YfhF  68.33 
 
 
120 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.33 
 
 
120 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3064  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  71.67 
 
 
119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70.69 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12232  hypothetical protein  68.33 
 
 
118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000227512  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10610  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  80.9 
 
 
125 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.213974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3568  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70.94 
 
 
125 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0534346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1530  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  81.11 
 
 
117 aa  159  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2945  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  74.29 
 
 
125 aa  157  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648608  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3082  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  69.17 
 
 
119 aa  157  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0030958  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2017  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70.59 
 
 
116 aa  151  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3258  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60 
 
 
122 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0083346  hitchhiker  0.0000911572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  47.37 
 
 
141 aa  120  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
130 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  54.08 
 
 
122 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  49.04 
 
 
116 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.55 
 
 
126 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.92 
 
 
139 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.04 
 
 
116 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.61 
 
 
120 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.28 
 
 
120 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.17 
 
 
122 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2673  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.28 
 
 
124 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.407171  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.28 
 
 
124 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
116 aa  103  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  46.23 
 
 
117 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
123 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0323  HesB/YadR/YfhF  42.86 
 
 
140 aa  103  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000000123552  hitchhiker  0.00657769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  47.12 
 
 
116 aa  103  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.15 
 
 
128 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
123 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
118 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  43.27 
 
 
113 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
130 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.54 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  44.23 
 
 
113 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
128 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
114 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.54 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
106 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.54 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
124 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.54 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.12 
 
 
116 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.04 
 
 
116 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
124 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.54 
 
 
116 aa  100  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
124 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
124 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
124 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.04 
 
 
116 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.02 
 
 
121 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.02 
 
 
121 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.94 
 
 
102 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2571  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.37717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.98 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  45.22 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.73 
 
 
132 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.73 
 
 
132 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.7 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1044  HesB/YadR/YfhF  47.47 
 
 
116 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0515022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
120 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
121 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  48.98 
 
 
117 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.98 
 
 
121 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.73 
 
 
132 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.7 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.7 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.7 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.18 
 
 
116 aa  99  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.98 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.04 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.04 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
123 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.04 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>