29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2197 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2197  alkylmercury lyase  100 
 
 		 317 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5375  alkylmercury lyase  46.43 
 
 		 214 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.54 
 
 		 767 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  32.39 
 
 		 767 aa  79  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  32.23 
 
 		 745 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3948  hypothetical protein  34.15 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.187867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4960  hypothetical protein  31.38 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0619333  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0426  alkylmercury lyase  28.64 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5374  Alkylmercury lyase  28.77 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02948  alkylmercury lyase  27.32 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1790  hypothetical protein  43.02 
 
 		 105 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4234  putative alkylmercury lyase  35.64 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0173287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3236  putative alkylmercury lyase  39.8 
 
 		 108 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3214  alkylmercury lyase  29.51 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00854121  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4512  alkylmercury lyase  27.06 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0148177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0243  alkylmercury lyase  27.84 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2556  hypothetical protein  42.11 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0164  alkylmercury lyase  25.28 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.581292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2835  putative alkylmercury lyase  35.71 
 
 		 115 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10713  hypothetical protein  33.99 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.259307 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5754  putative alkylmercury lyase  38.78 
 
 		 103 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2324  organomercurial lyase  33.33 
 
 		 181 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25630  alkylmercury lyase  27.49 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1768  alkylmercury lyase  31.37 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.628119  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2087  alkylmercury lyase  32.73 
 
 		 133 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.302578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2330  alkylmercury lyase  27.62 
 
 		 215 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0726495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1647  putative alkylmercury lyase  35.64 
 
 		 99 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.394016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  32.04 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1769  alkylmercury lyase  26.45 
 
 		 186 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>