More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0085 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 
112 aa  223  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  85.71 
 
 
112 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  83.93 
 
 
112 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  187  3e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  187  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  187  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  187  6e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  185  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  183  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
116 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
116 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  6e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  74.11 
 
 
116 aa  173  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  173  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  73.21 
 
 
112 aa  172  1e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  171  2e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 
112 aa  171  2e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 
112 aa  171  2e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  171  2e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  171  3e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  171  4e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  171  4e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  171  4e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  170  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  71.43 
 
 
112 aa  170  7e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  69.64 
 
 
112 aa  169  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  71.43 
 
 
112 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0555  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  168  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  167  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  167  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  166  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 
112 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  164  3e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0076  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  164  3e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0461291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  3e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  164  3e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
121 aa  164  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.14835e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3050  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  164  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  164  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  164  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.56099e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  163  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  66.96 
 
 
112 aa  162  1e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  162  1e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  162  1e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  162  1e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
136 aa  162  2e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 
112 aa  162  2e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  161  2e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  161  2e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  2e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  67.86 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  161  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  160  4e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  160  4e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
136 aa  160  4e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
136 aa  160  5e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  5e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  160  8e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  67.86 
 
 
112 aa  159  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  159  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>