54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2219 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  100 
 
 
307 aa  597  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  1.95606e-07  decreased coverage  8.30578e-07 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  50.33 
 
 
312 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  50.17 
 
 
307 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  40.91 
 
 
298 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  39.26 
 
 
285 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  41.33 
 
 
303 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  33.65 
 
 
309 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  36.57 
 
 
295 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  37.86 
 
 
265 aa  110  4e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.22 
 
 
300 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
329 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1422  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.77 
 
 
373 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5998e-08 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4780  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  36.9 
 
 
288 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.35446  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1410  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.189739  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5323  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  36.53 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.86 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24730  streptomycin 6-kinase  31.72 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0213  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.69 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53187  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.23 
 
 
310 aa  80.5  3e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.93 
 
 
279 aa  79  9e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.93 
 
 
279 aa  79  9e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.93 
 
 
279 aa  79  9e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  33.8 
 
 
293 aa  78.6  1e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.48 
 
 
310 aa  77.4  3e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3331  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.43 
 
 
300 aa  75.1  1e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30370  streptomycin 6-kinase  30.8 
 
 
326 aa  73.2  5e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  32.01 
 
 
273 aa  71.6  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.31 
 
 
271 aa  69.3  7e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  24.2 
 
 
323 aa  67.8  2e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3891  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.71 
 
 
271 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.571465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2684  hypothetical protein  43.18 
 
 
93 aa  67  4e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1244  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.71 
 
 
272 aa  66.6  5e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761762  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7130  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.57 
 
 
267 aa  66.2  6e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  31.54 
 
 
273 aa  66.2  6e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.47 
 
 
264 aa  65.9  9e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0298  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.04 
 
 
309 aa  65.1  1e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.449073 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  24.2 
 
 
468 aa  64.3  2e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.5 
 
 
284 aa  64.3  2e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  3.51208e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  30.62 
 
 
265 aa  60.5  3e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  26.35 
 
 
306 aa  57.8  2e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2987  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28 
 
 
266 aa  57.4  3e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0510787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2726  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.26 
 
 
266 aa  56.6  5e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167772  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.43 
 
 
270 aa  55.8  8e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1571  aminoglycoside resistance protein B  30.81 
 
 
281 aa  53.5  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.078076  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0045  streptomycin resistance protein StrB  30.81 
 
 
276 aa  53.5  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2670  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.81 
 
 
276 aa  53.5  4e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02986  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5338  streptomycin phosphotransferase  30.81 
 
 
278 aa  53.5  5e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0084  streptomycin phosphotransferase B  30.77 
 
 
260 aa  53.1  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.707576 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0129  aminoglycoside resistance protein B  30.81 
 
 
276 aa  52.8  8e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974008  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2660  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.92 
 
 
302 aa  51.6  2e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  52.94 
 
 
592 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1673  streptomycin resistance protein  32.74 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3719  streptomycin 3''-kinase  31.73 
 
 
266 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0248  putative streptomycin phosphotransferase  36.36 
 
 
120 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>