38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1968 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1968  protein of unknown function UCP012608  100 
 
 
328 aa  634  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  1.82349e-07  unclonable  4.14728e-08 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07770  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  53.04 
 
 
322 aa  273  2e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3393  hypothetical protein  46.57 
 
 
339 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1412  hypothetical protein  53.31 
 
 
311 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127467  hitchhiker  1.36786e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0324  protein of unknown function UCP012608  49.84 
 
 
327 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00596462  normal  0.0240651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1455  hypothetical protein  55 
 
 
294 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01400  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  47.78 
 
 
325 aa  213  5e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4596  hypothetical protein  48 
 
 
274 aa  201  2e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2974  hypothetical protein  31.54 
 
 
348 aa  131  2e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06550  hypothetical protein  38.78 
 
 
391 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2711  hypothetical protein  32.73 
 
 
348 aa  128  1e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00787314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2973  hypothetical protein  32.36 
 
 
348 aa  128  2e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2767  hypothetical protein  31.86 
 
 
348 aa  127  2e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2761  hypothetical protein  32.36 
 
 
348 aa  128  2e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0637564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3010  hypothetical protein  31.64 
 
 
348 aa  126  4e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2969  hypothetical protein  32.36 
 
 
348 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.26097e-07 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0177  hypothetical protein  33.67 
 
 
353 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.607974  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3010  hypothetical protein  31.64 
 
 
348 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2691  hypothetical protein  32 
 
 
348 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0817  hypothetical protein  34.82 
 
 
355 aa  121  1e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2269  hypothetical protein  33.69 
 
 
241 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0672878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2426  protein of unknown function UCP012608  36.04 
 
 
354 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1037  hypothetical protein  35.96 
 
 
371 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.0209911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2746  hypothetical protein  35.6 
 
 
355 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10704  hypothetical protein  31.67 
 
 
349 aa  82  1e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3766  hypothetical protein  39.47 
 
 
349 aa  77  4e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4153  hypothetical protein  32.34 
 
 
363 aa  73.6  5e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.989771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6238  hypothetical protein  36.69 
 
 
358 aa  72.8  7e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0814  hypothetical protein  34.93 
 
 
362 aa  72  1e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3591  hypothetical protein  41.22 
 
 
356 aa  69.7  7e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0225  protein of unknown function UCP012608  32.32 
 
 
179 aa  66.6  5e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7454  hypothetical protein  34.15 
 
 
347 aa  64.3  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5646  hypothetical protein  33.14 
 
 
372 aa  57.4  3e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2028  hypothetical protein  30.36 
 
 
359 aa  56.2  8e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0858  hypothetical protein  31.21 
 
 
373 aa  53.1  6e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4402  hypothetical protein  36.43 
 
 
372 aa  50.1  5e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1263  hypothetical protein  33.69 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2918  hypothetical protein  32.6 
 
 
353 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>