37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2746 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2746  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  712    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3766  hypothetical protein  61.52 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0858  hypothetical protein  45.77 
 
 		 373 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3591  hypothetical protein  44.22 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1263  hypothetical protein  46.7 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7454  hypothetical protein  44.02 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774061  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4153  hypothetical protein  39.36 
 
 		 363 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.989771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10704  hypothetical protein  38.95 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2918  hypothetical protein  38.62 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6238  hypothetical protein  39.81 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2028  hypothetical protein  34.78 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0814  hypothetical protein  34.99 
 
 		 362 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2974  hypothetical protein  27.24 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2761  hypothetical protein  27.39 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0637564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2973  hypothetical protein  27.39 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2767  hypothetical protein  27 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2711  hypothetical protein  27.39 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00787314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2969  hypothetical protein  27.39 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000226097 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3010  hypothetical protein  26.97 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2691  hypothetical protein  27.57 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3010  hypothetical protein  27.06 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2269  hypothetical protein  27.66 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0672878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4596  hypothetical protein  33.97 
 
 		 274 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3393  hypothetical protein  34.65 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0324  protein of unknown function UCP012608  38.25 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00596462  normal  0.0240651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1968  protein of unknown function UCP012608  35.6 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000182349  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0177  hypothetical protein  28.25 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.607974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07770  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  31.97 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1037  hypothetical protein  28.38 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.0209911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1455  hypothetical protein  32.34 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1412  hypothetical protein  34.48 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127467  hitchhiker  0.0000136786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01400  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  32.11 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06550  hypothetical protein  32.65 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0817  hypothetical protein  36.11 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4402  hypothetical protein  30.98 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2426  protein of unknown function UCP012608  34.88 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5646  hypothetical protein  25.41 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>