38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2426 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2426  protein of unknown function UCP012608  100 
 
 
354 aa  677    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2969  hypothetical protein  29.8 
 
 
348 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000226097 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07770  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  39.94 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2711  hypothetical protein  29.47 
 
 
348 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00787314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2761  hypothetical protein  28.81 
 
 
348 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0637564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2691  hypothetical protein  29.47 
 
 
348 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2973  hypothetical protein  28.81 
 
 
348 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3393  hypothetical protein  34.35 
 
 
339 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3010  hypothetical protein  28.48 
 
 
348 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2974  hypothetical protein  26.82 
 
 
348 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3010  hypothetical protein  28.48 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357086  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0177  hypothetical protein  34.68 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.607974  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2767  hypothetical protein  28.52 
 
 
348 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0324  protein of unknown function UCP012608  37.83 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00596462  normal  0.0240651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06550  hypothetical protein  33.61 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1968  protein of unknown function UCP012608  37.66 
 
 
328 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000182349  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4596  hypothetical protein  38.35 
 
 
274 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1412  hypothetical protein  36.54 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127467  hitchhiker  0.0000136786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0817  hypothetical protein  34.56 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1455  hypothetical protein  38.71 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1037  hypothetical protein  32.24 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.0209911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2269  hypothetical protein  29.26 
 
 
241 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0672878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01400  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  30.74 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2746  hypothetical protein  33.77 
 
 
355 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0814  hypothetical protein  33.81 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4153  hypothetical protein  30.23 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.989771  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1263  hypothetical protein  32.59 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10704  hypothetical protein  30.8 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3591  hypothetical protein  35.96 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6238  hypothetical protein  33.9 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3766  hypothetical protein  33.48 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0858  hypothetical protein  28.47 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7454  hypothetical protein  35 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5646  hypothetical protein  32.97 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4402  hypothetical protein  38.76 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2918  hypothetical protein  29.96 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2028  hypothetical protein  29.15 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0225  protein of unknown function UCP012608  25.83 
 
 
179 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>