10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0085 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0085    100 
 
 		 1367 bp  2710    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03010  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  89.74 
 
 		 1329 bp  91.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0279  pyridoxal-dependent decarboxylase  94.74 
 
 		 1386 bp  60  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6535  pyridoxal-dependent decarboxylase  92.86 
 
 		 1425 bp  60  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  96.88 
 
 		 1377 bp  56  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4345  diguanylate cyclase  96.67 
 
 		 1842 bp  52  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.609147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0726  hypothetical protein  96.55 
 
 		 612 bp  50.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6192  Pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 		 1479 bp  50.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.478239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  100 
 
 		 1182 bp  48.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3117  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  100 
 
 		 1020 bp  48.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>