25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2346 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2346  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  261  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2666  hypothetical protein  88.46 
 
 
130 aa  234  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2389  hypothetical protein  88.46 
 
 
130 aa  234  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0218  hypothetical protein  56.07 
 
 
126 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0439121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4822  hypothetical protein  42.98 
 
 
119 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3136  hypothetical protein  49.18 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5426  hypothetical protein  56.57 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4462  hypothetical protein  37.6 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0217  hypothetical protein  38.95 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0838  hypothetical protein  38.24 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1776  hypothetical protein  34.88 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1792  hypothetical protein  32.79 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.000000000573078  normal  0.10017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7083  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.200411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1012  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.12519  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0702  hypothetical protein  37.89 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594351  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0760  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0042  hypothetical protein  37.27 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4346  hypothetical protein  31.25 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1324  putative exported protein of unknown function  32.32 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903845  normal  0.229957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4730  hypothetical protein  31.96 
 
 
123 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0167  hypothetical protein  35.45 
 
 
141 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537871  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1692  hypothetical protein  33.68 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0363  hypothetical protein  26.45 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6223  hypothetical protein  26.8 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0450  hypothetical protein  33.93 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>