13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8350 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8350  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3970  transposase IS4 family protein  65.75 
 
 
534 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5026  transposase-like protein  46.43 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0403517  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  43.84 
 
 
458 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  43.84 
 
 
451 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  43.84 
 
 
451 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  43.84 
 
 
451 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  46.58 
 
 
418 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  46.58 
 
 
418 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4740  putative transposase  45 
 
 
358 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  50 
 
 
444 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  50 
 
 
445 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1062  putative transposase  37.84 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>