15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3787 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  45.45 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  39.71 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  37.74 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  46.51 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  29.03 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  37.93 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  47.73 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  29.49 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  31.58 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  29.79 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  44.44 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  42.55 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  33.85 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  29.81 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>