23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1960 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  617  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  27.16 
 
 
294 aa  84  3e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  32.74 
 
 
316 aa  71.6  2e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  27.53 
 
 
305 aa  70.9  3e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  25.1 
 
 
318 aa  64.7  2e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  24.63 
 
 
308 aa  62  1e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  25.67 
 
 
320 aa  61.6  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  23.95 
 
 
318 aa  57.4  3e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  29.96 
 
 
318 aa  56.6  6e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  31.63 
 
 
316 aa  56.2  7e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  30.34 
 
 
325 aa  55.8  9e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  29.44 
 
 
327 aa  55.1  1e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1821  hypothetical protein  22.01 
 
 
321 aa  53.5  4e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  23.2 
 
 
321 aa  53.5  5e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  27.9 
 
 
297 aa  52  1e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3697  hypothetical protein  26.11 
 
 
307 aa  50.4  4e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2414  hypothetical protein  26.11 
 
 
307 aa  50.1  5e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  27.68 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  27.84 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04891  hypothetical protein  19.67 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.879079 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07041  hypothetical protein  25.3 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  25.19 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>