25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1560 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  100 
 
 		 89 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  81.82 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  83.15 
 
 		 89 aa  148  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0432  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  69.66 
 
 		 89 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00986722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  47.19 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.96 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.96 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.82 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.2 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  31.4 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.88 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  37.88 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  30.23 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  27.27 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44439  predicted protein  32.18 
 
 		 210 aa  52.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  26.74 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.4 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0367  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.89 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10601  predicted protein  32.2 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02240  signal recognition particle protein, putative  32.39 
 
 		 355 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0519  signal recognition particle, subunit SRP19  28.74 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0576  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.91 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00280682 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1514  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  26.25 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.917345  normal  0.846669 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1731  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  32.08 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.583276 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1566  ribonucleoprotein complex SRP, SRP19 component  26.44 
 
 		 95 aa  40  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>