18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1038 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  100 
 
 
535 aa  1062    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  83.83 
 
 
531 aa  885    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  81.39 
 
 
532 aa  850    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  33.15 
 
 
532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  33.39 
 
 
558 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  31.35 
 
 
567 aa  223  6e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  32.52 
 
 
561 aa  223  8e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  33.27 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  31.65 
 
 
533 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  31.57 
 
 
538 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  34.24 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  32.97 
 
 
532 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  30.97 
 
 
1336 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  45.33 
 
 
437 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0802  S-layer protein  38.67 
 
 
444 aa  53.5  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.648701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0084  S-layer protein  37.33 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  40.91 
 
 
976 aa  50.8  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0737  hypothetical protein  33.82 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.854836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>