17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0068 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0068  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  137  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.471063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4186  hypothetical protein  59.65 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0412  hypothetical protein  50.79 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2761  hypothetical protein  54 
 
 
60 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622446  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2912  hypothetical protein  54.9 
 
 
62 aa  62.8  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1505  hypothetical protein  51.67 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1027  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0201  hypothetical protein  54.9 
 
 
59 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2688  hypothetical protein  49.09 
 
 
59 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0965838  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2318  hypothetical protein  53.33 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1680  hypothetical protein  53.06 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2845  hypothetical protein  46.3 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1922  hypothetical protein  47.37 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1854  hypothetical protein  47.06 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12532  normal  0.868488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08049  Lactobacillus shifted protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUI1]  47.06 
 
 
213 aa  43.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01400  conserved hypothetical protein  48.57 
 
 
144 aa  43.5  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47885  predicted protein  37.5 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00102628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>