31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0770 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
414 aa  853    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
414 aa  853    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
414 aa  853    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.66 
 
 
457 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  32.49 
 
 
429 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.81 
 
 
356 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.07 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  22.26 
 
 
502 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.86 
 
 
1034 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.44 
 
 
1034 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.94 
 
 
773 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.27 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  24.56 
 
 
586 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  24.75 
 
 
507 aa  63.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.75 
 
 
432 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.36 
 
 
628 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.71 
 
 
626 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  25 
 
 
889 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  30.07 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.87 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.39 
 
 
632 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.26 
 
 
1061 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.27 
 
 
1074 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  23.46 
 
 
606 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  21.93 
 
 
388 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.32 
 
 
446 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  22.89 
 
 
423 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.81 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.93 
 
 
824 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  26.02 
 
 
815 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.63 
 
 
439 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>