275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0012 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  100 
 
 
78 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  100 
 
 
78 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  97.44 
 
 
78 aa  155  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  92.31 
 
 
78 aa  149  9e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1126  BolA family protein  93.59 
 
 
78 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  88.46 
 
 
78 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3710  BolA-like protein  74.03 
 
 
78 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778992  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1789  BolA family protein  75.32 
 
 
78 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1594  BolA-like protein  76.32 
 
 
78 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1755  BolA-like protein  74.03 
 
 
78 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1309  BolA-like protein  71.43 
 
 
77 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  73.68 
 
 
77 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1637  BolA-like protein  71.43 
 
 
77 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  73.08 
 
 
78 aa  118  2e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5397  hypothetical protein  72.37 
 
 
79 aa  117  4e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2390  BolA family protein  70.13 
 
 
77 aa  116  1e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0836  bolA-related protein  68.83 
 
 
77 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0828  bolA-related protein  68.83 
 
 
77 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  67.53 
 
 
77 aa  112  2e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  68.83 
 
 
78 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1276  BolA-like protein  67.53 
 
 
77 aa  111  4e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  72.73 
 
 
77 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5884  hypothetical protein  67.53 
 
 
77 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206517  normal  0.559405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4711  BolA family protein  68.42 
 
 
77 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1506  BolA family protein  64.94 
 
 
77 aa  107  8e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935248  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0707  BolA-like protein  67.95 
 
 
77 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  66.23 
 
 
77 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0864  BolA family protein  63.16 
 
 
77 aa  103  6e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1939  BolA/YrbA family protein  63.64 
 
 
78 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3118  BolA family protein  61.04 
 
 
77 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2145  BolA family protein  63.64 
 
 
77 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230515  normal  0.346751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1935  BolA family protein  62.34 
 
 
77 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1185  BolA family protein  53.25 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.234576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  57.89 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0356  BolA-like protein  59.74 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1391  BolA family protein  56.25 
 
 
80 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45441  normal  0.295987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2952  BolA-like protein  54.43 
 
 
80 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3464  BolA family protein  52.56 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296353  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1597  BolA family protein  53.16 
 
 
80 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0816624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  53.95 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  2.72447e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  53.95 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0893  BolA family protein  50.63 
 
 
80 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0866848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  51.95 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1417  BolA family protein  54.29 
 
 
77 aa  81.3  4e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.415851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  51.39 
 
 
82 aa  81.6  4e-15  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  52.05 
 
 
80 aa  80.9  6e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  52.05 
 
 
85 aa  80.1  8e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  53.42 
 
 
86 aa  80.1  1e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  52.05 
 
 
78 aa  80.1  1e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  50 
 
 
78 aa  79.3  2e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09531  BolA-like protein  52.78 
 
 
77 aa  78.2  3e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.336163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1117  BolA-like protein  50 
 
 
78 aa  78.2  3e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  51.39 
 
 
88 aa  77  8e-14  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10771  BolA-like protein  47.22 
 
 
77 aa  76.6  1e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.42913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1712  hypothetical protein  48.1 
 
 
77 aa  74.7  4e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0263  BolA family protein  41.89 
 
 
80 aa  74.3  5e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0466064  normal  0.451976 
 
 
-
 
NC_002978  WD0490  hypothetical protein  45.33 
 
 
72 aa  73.2  1e-12  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.529866  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  44 
 
 
76 aa  69.7  1e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0640  BolA-like protein  44 
 
 
76 aa  68.9  2e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  43.84 
 
 
88 aa  67.4  7e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0303  BolA family protein  37.33 
 
 
73 aa  67.4  7e-11  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.321518  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  46.67 
 
 
110 aa  66.6  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  46.67 
 
 
110 aa  66.6  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0204  BolA family protein  42.86 
 
 
79 aa  66.6  1e-10  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0507648  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0700  BolA-like protein  37.33 
 
 
76 aa  65.9  2e-10  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.088559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  44.74 
 
 
75 aa  65.9  2e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  43.42 
 
 
75 aa  64.3  5e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1611  BolA family protein  40.28 
 
 
78 aa  64.3  6e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  44.74 
 
 
76 aa  63.9  7e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  40.28 
 
 
80 aa  63.2  1e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  41.67 
 
 
78 aa  63.5  1e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  40.28 
 
 
78 aa  63.2  1e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  38.96 
 
 
81 aa  62  2e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12011  BolA-like protein  41.67 
 
 
76 aa  62.8  2e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  36.99 
 
 
79 aa  61.6  4e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  42.11 
 
 
75 aa  61.2  5e-09  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  38.89 
 
 
79 aa  60.8  5e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  40 
 
 
83 aa  61.2  5e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1822  BolA family protein  44.74 
 
 
84 aa  60.5  7e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  40.28 
 
 
82 aa  60.5  9e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  40.28 
 
 
79 aa  59.3  1e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  39.44 
 
 
79 aa  59.7  1e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  39.44 
 
 
79 aa  59.7  1e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  40.28 
 
 
79 aa  59.3  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  39.44 
 
 
79 aa  59.7  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  40.28 
 
 
79 aa  59.3  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  40.28 
 
 
79 aa  59.3  1e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  39.44 
 
 
79 aa  59.7  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  40.28 
 
 
79 aa  59.3  1e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  40.28 
 
 
79 aa  59.3  1e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  39.44 
 
 
79 aa  59.7  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  39.44 
 
 
79 aa  59.7  1e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  39.44 
 
 
79 aa  59.7  1e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1121  BolA-like protein  38.16 
 
 
76 aa  60.1  1e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  38.96 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  39.44 
 
 
79 aa  59.7  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2781  BolA-like protein  40.54 
 
 
75 aa  59.7  1e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  41.43 
 
 
81 aa  59.3  2e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  43.24 
 
 
85 aa  58.9  2e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  42.11 
 
 
88 aa  57.8  4e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>