19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0402 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0402  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  502  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2270  hypothetical protein  61.7 
 
 
250 aa  289  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.120252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0151  protein of unknown function DUF549  56.49 
 
 
243 aa  271  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.478263  normal  0.0288221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0610  hypothetical protein  50 
 
 
241 aa  250  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.494151  normal  0.0213436 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0759  hypothetical protein  53.16 
 
 
240 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.262014  normal  0.526798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1464  hypothetical protein  43.04 
 
 
243 aa  221  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1746  hypothetical protein  43.33 
 
 
243 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0875  hypothetical protein  41.91 
 
 
235 aa  175  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5797  tRNA(His)-5'-guanylyltransferase  31.36 
 
 
255 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1513  protein of unknown function DUF549  31.65 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4049  hypothetical protein  28.63 
 
 
252 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4028  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510799 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2087  hypothetical protein  27.75 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000512011  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02800  tRNA guanylyltransferase, putative  24.63 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1144  hypothetical protein  35.94 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000378102 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0097  hypothetical protein  36.72 
 
 
212 aa  56.6  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0393817  hitchhiker  0.0023307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0105  hypothetical protein  37.5 
 
 
196 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0070  hypothetical protein  38.46 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.979925 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60761  predicted protein  26.4 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0820783  normal  0.624062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>