18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5797 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5797  tRNA(His)-5'-guanylyltransferase  100 
 
 		 255 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1513  protein of unknown function DUF549  59.84 
 
 		 258 aa  338  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4049  hypothetical protein  58.13 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0610  hypothetical protein  35.22 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.494151  normal  0.0213436 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0402  hypothetical protein  31.36 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2270  hypothetical protein  31.71 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.120252 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02800  tRNA guanylyltransferase, putative  32.29 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1464  hypothetical protein  29.44 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1746  hypothetical protein  31.44 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0759  hypothetical protein  31.31 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.262014  normal  0.526798 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60761  predicted protein  31.28 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0820783  normal  0.624062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0151  protein of unknown function DUF549  29.41 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.478263  normal  0.0288221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0875  hypothetical protein  27.95 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4028  hypothetical protein  31.21 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510799 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00804  tRNAHis guanylyltransferase Thg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14630)  27.62 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.142113 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000512011  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0105  hypothetical protein  30.7 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1144  hypothetical protein  31.13 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000378102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>