33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1034 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1034  hypothetical protein  100 
 
 
1161 aa  2306    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2016  hypothetical protein  51.31 
 
 
868 aa  824    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0853096  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0268  S-layer-related protein  48.48 
 
 
867 aa  786    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2129  S-layer-like domain-containing protein  50.65 
 
 
1304 aa  813    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00431402  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0149  S-layer-like domain-containing protein  41.58 
 
 
1113 aa  635  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0677  S-layer-like domain-containing protein  36.99 
 
 
720 aa  352  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0713079  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1177  S-layer-like domain-containing protein  30.43 
 
 
874 aa  294  6e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2011  hypothetical protein  32.74 
 
 
681 aa  287  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1690  S-layer-related protein  32.41 
 
 
677 aa  283  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.351956  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1758  hypothetical protein  30.51 
 
 
668 aa  250  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  27.38 
 
 
1096 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1577  hypothetical protein  24.59 
 
 
744 aa  128  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1775  hypothetical protein  24.46 
 
 
586 aa  111  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664356  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  29.78 
 
 
1200 aa  99.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1815  hypothetical protein  28.14 
 
 
617 aa  72  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1816  hypothetical protein  25.87 
 
 
505 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0271443  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1089  cell surface protein  25.24 
 
 
396 aa  64.3  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.415755  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3744  hypothetical protein  29.38 
 
 
416 aa  55.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1156  hypothetical protein  30.57 
 
 
241 aa  54.3  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  25.99 
 
 
1126 aa  53.5  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2106  hypothetical protein  27.97 
 
 
594 aa  52.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.057671  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0492  hypothetical protein  29.35 
 
 
884 aa  50.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1384  hypothetical protein  28.79 
 
 
510 aa  50.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3343  hypothetical protein  35.48 
 
 
786 aa  49.3  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30 
 
 
756 aa  48.9  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.66 
 
 
778 aa  47.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1946  hypothetical protein  33.33 
 
 
565 aa  47.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.67 
 
 
778 aa  47  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0365  putative glycyl aminopeptidase  30 
 
 
715 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147236  normal  0.340206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3508  hypothetical protein  34.18 
 
 
394 aa  45.8  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  38.04 
 
 
762 aa  45.8  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.48 
 
 
801 aa  45.8  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  30.69 
 
 
772 aa  44.7  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>