53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0329 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0329  glutaredoxin  100 
 
 
85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.923788  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0503  redox-active disulfide protein 1  55.84 
 
 
82 aa  94  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  50.63 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0941  redox-active disulfide protein 1  51.81 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.917441  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  49.37 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1773  redox-active disulfide protein 1  49.37 
 
 
80 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0153  glutaredoxin-like domain-containing protein  37.35 
 
 
230 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.369669  normal  0.0212592 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1145  glutaredoxin  40 
 
 
100 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0311964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1173  glutaredoxin-like domain protein  34.94 
 
 
233 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545733  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2727  dehydrogenase, selenocysteine-containing protein  35.82 
 
 
228 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.305713  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1277  glutaredoxin-like domain protein  29.11 
 
 
216 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0102  hypothetical protein  35.71 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0850062  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2867  thioredoxin family protein  34.29 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.940761  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2488  hypothetical protein  34.29 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3949  glutaredoxin-like domain-containing protein  33.33 
 
 
219 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2049  glutaredoxin-like domain protein  31.08 
 
 
230 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1101  NADH dehydrogenase  31.51 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  32.35 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1202  thioredoxin, putative  34.92 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3623  glutaredoxin-like domain-containing protein  31.33 
 
 
219 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0051  glutaredoxin-like domain protein  33.33 
 
 
220 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  normal  0.790118 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0856  redox-active disulfide protein 2  33.75 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0536  redox-active disulfide protein 2  27.27 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2778  redox-active disulfide protein 2  27.63 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  30.77 
 
 
109 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  29.33 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3831  redox-active disulfide protein 2  25.97 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  31.25 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0493  redox-active disulfide protein 2  25.97 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  35.29 
 
 
555 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3957  redox-active disulfide protein 2  25.97 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0759  glutaredoxin-like domain protein  29.85 
 
 
227 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  33.9 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3496  redox-active disulfide protein 2  27.78 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0535  redox-active disulfide protein 2  27.78 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3775  redox-active disulfide protein 2  25.97 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.16 
 
 
366 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>