14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3002 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  52.15 
 
 		 278 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  40.1 
 
 		 299 aa  158  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  43.05 
 
 		 309 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  36.36 
 
 		 352 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  35.12 
 
 		 277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  33.16 
 
 		 273 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  31.77 
 
 		 273 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  33.68 
 
 		 268 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  32.78 
 
 		 279 aa  99.8  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  33.52 
 
 		 271 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  28.85 
 
 		 323 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  25.2 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>