21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0040 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0040  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  959    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2947  hypothetical protein  40.39 
 
 		 481 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0687281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3224  hypothetical protein  39.3 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2030  hypothetical protein  39.08 
 
 		 481 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.533222  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3002  hypothetical protein  39.08 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0878761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3232  hypothetical protein  39.08 
 
 		 481 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3238  hypothetical protein  38.65 
 
 		 481 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2989  hypothetical protein  38.43 
 
 		 482 aa  352  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3256  hypothetical protein  39.3 
 
 		 481 aa  353  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.218487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2927  hypothetical protein  38.65 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3259  hypothetical protein  39.37 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1698  hypothetical protein  48.33 
 
 		 417 aa  250  4e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.41368e-16 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.05 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  28.69 
 
 		 521 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.61 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.45 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.09 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.68 
 
 		 559 aa  100  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  25.92 
 
 		 514 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.71 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.36 
 
 		 605 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>