80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0003 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  100 
 
 		 73 aa  148  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  56.67 
 
 		 70 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  49.28 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  56.67 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  50.72 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  50.72 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  50.72 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  50.72 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  50.72 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  50.72 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  50.72 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  57.38 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  55 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  54.17 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  46.38 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  48.53 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  55.17 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  57.69 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  55.77 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  55.77 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  52.54 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1990  hypothetical protein  53.57 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2237  hypothetical protein  44.12 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  37.68 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  45.16 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  45.76 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  39.44 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.85 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  47.37 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.75 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.03 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  38.71 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  37.1 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  47.06 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  47.17 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  40 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0086  hypothetical protein  42 
 
 		 56 aa  47  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  44 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0003  S4 domain-containing protein  40.32 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0003  S4-like RNA binding protein  44.19 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.31544e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.33 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  42.59 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  43.75 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3548  RNA-binding S4 domain protein  44 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  46 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  36.51 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  39.29 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.72 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  40.98 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  48 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  40.3 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  34.72 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.72 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  34.85 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  35.82 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  40.35 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  40.35 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  39.29 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  39.29 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.83 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  37.29 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  37.29 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2576  RNA-binding S4 domain protein  44 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.34 
 
 		 92 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.29 
 
 		 71 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3530  RNA-binding S4 domain protein  44 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 71 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07580  hypothetical protein  33.85 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.87858  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.23 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf004  hypothetical protein  34.43 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  36.07 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2510  RNA-binding S4  31.51 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  31.03 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  36.84 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  35.94 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  32.79 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  35.48 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>