23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2176 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  270  4e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  3.45804e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  270  4e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  63.91 
 
 
133 aa  172  2e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  63.28 
 
 
135 aa  163  6e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  45.9 
 
 
125 aa  109  1e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  44.26 
 
 
125 aa  107  4e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  40.6 
 
 
133 aa  102  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  6.10155e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  34.65 
 
 
125 aa  70.1  9e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  34.65 
 
 
125 aa  70.1  9e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  2.15386e-11 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  31.2 
 
 
127 aa  68.6  3e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  29.37 
 
 
133 aa  64.3  6e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  31.68 
 
 
122 aa  63.5  9e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  31.68 
 
 
122 aa  62.4  2e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  28.04 
 
 
125 aa  57.8  4e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  31.36 
 
 
120 aa  57  9e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  30.68 
 
 
124 aa  56.6  1e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  28.57 
 
 
133 aa  54.7  4e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  28.04 
 
 
125 aa  50.1  9e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  31.11 
 
 
125 aa  49.3  2e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  31.11 
 
 
125 aa  49.3  2e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  32.47 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  25.62 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  26.27 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>