11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0100 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0100  putative lipoprotein  100 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0555  putative lipoprotein  42.19 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.824529  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4090  hypothetical protein  35.44 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0973  hypothetical protein  34.5 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1246  hypothetical protein  30.58 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1462  hypothetical protein  34.03 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4232  hypothetical protein  36.36 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.182631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0515  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0493  hypothetical protein  33.15 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.838397  normal  0.0794721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0504  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  30.26 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>