28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0850 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  214  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  35.16 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  36.19 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  33 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  33 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  33 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  33 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  33 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  31.96 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  32 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  32.26 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  32.26 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  32 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  33.67 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  32.58 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  31.63 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  32.04 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  31.46 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  26.85 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  30.34 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  26.67 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  31.63 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  24.53 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  27.27 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  32.18 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  29.7 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  28.72 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>