28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0929 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 692 aa  1324    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  55.25 
 
 		 638 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  44.56 
 
 		 619 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  44.02 
 
 		 673 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  43.05 
 
 		 675 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  43.19 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  41.47 
 
 		 654 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  38.61 
 
 		 867 aa  296  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  34.14 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  34.11 
 
 		 770 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  28.33 
 
 		 633 aa  247  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  31.59 
 
 		 603 aa  246  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  33.88 
 
 		 659 aa  229  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  32.99 
 
 		 651 aa  214  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  32.78 
 
 		 593 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  31.67 
 
 		 651 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  31.62 
 
 		 644 aa  181  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 616 aa  174  5.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  27.82 
 
 		 624 aa  165  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 623 aa  144  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  21.68 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  26.68 
 
 		 624 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  27.53 
 
 		 580 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  23.24 
 
 		 615 aa  98.6  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  25.13 
 
 		 593 aa  94.7  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  24.44 
 
 		 551 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  25 
 
 		 742 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.95 
 
 		 1072 aa  50.8  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>