27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0102 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  294  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  30.66 
 
 
136 aa  67.8  5e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  60.1  9e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  29.6 
 
 
157 aa  60.1  1e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  31.54 
 
 
138 aa  57.4  6e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  31.54 
 
 
138 aa  57.4  6e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  31.54 
 
 
138 aa  57  8e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  26.72 
 
 
158 aa  55.8  2e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  26.47 
 
 
161 aa  52.8  1e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  23.66 
 
 
158 aa  51.2  4e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  50.8  6e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  29 
 
 
162 aa  49.3  2e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  32.56 
 
 
135 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  28.26 
 
 
140 aa  49.3  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  24.14 
 
 
147 aa  48.1  4e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  30.85 
 
 
138 aa  48.1  4e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  23.19 
 
 
138 aa  47.8  6e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  23.19 
 
 
138 aa  47.8  6e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  20.59 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  25 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  22.48 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  27.41 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  24.03 
 
 
141 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  24.62 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  23.16 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  25.19 
 
 
138 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>