24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1286 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  254  3e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  65.04 
 
 
125 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  65.04 
 
 
125 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  33.91 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  32.32 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  37.07 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  32.56 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  36.59 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  40.22 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  37.8 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  40.23 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  34.75 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  39.08 
 
 
122 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  34.75 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  32.08 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  36.46 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  30.68 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  30.68 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  31.91 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  34.15 
 
 
120 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  38.16 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  30.3 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  24.09 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  33.9 
 
 
160 aa  40  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>