32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1279 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1279  fumarate reductase subunit C  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000508075  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0341  fumarate reductase subunit C  51.75 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3838  fumarate reductase subunit C  47.2 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03986  hypothetical protein  47.2 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5670  fumarate reductase subunit C  47.2 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4684  fumarate reductase subunit C  47.2 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4623  fumarate reductase subunit C  47.2 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3858  fumarate reductase subunit C  47.2 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4711  fumarate reductase subunit C  47.2 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4396  fumarate reductase subunit C  47.2 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04024  fumarate reductase subunit C  47.2 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4759  fumarate reductase subunit C  51.72 
 
 		 131 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0417  fumarate reductase subunit C  48.48 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0380  fumarate reductase subunit C  45.74 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4619  fumarate reductase subunit C  50.86 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4611  fumarate reductase subunit C  50.86 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368113  normal  0.646266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4702  fumarate reductase subunit C  50.86 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4738  fumarate reductase subunit C  50.86 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3760  fumarate reductase subunit C  50.88 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3669  fumarate reductase subunit C  45.38 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3815  fumarate reductase subunit C  45.38 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0716  fumarate reductase subunit C  45.38 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3938  fumarate reductase subunit C  48.25 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0469  fumarate reductase subunit C  49.15 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002235  fumarate reductase subunit C  38.1 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2790  fumarate reductase subunit C  38.1 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00133  fumarate reductase subunit C  36.51 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2232  fumarate reductase subunit C  35.71 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3280  fumarate reductase, subunit C  36.72 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0352  fumarate reductase subunit C  30.91 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1448  fumarate reductase, 15 kDa hydrophobic protein  26.55 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11586  fumarate reductase subunit C  28.45 
 
 		 126 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432879  normal  0.974077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>