33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0716 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0716  fumarate reductase subunit C  100 
 
 
130 aa  259  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3815  fumarate reductase subunit C  99.23 
 
 
130 aa  258  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3669  fumarate reductase subunit C  99.23 
 
 
130 aa  258  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0417  fumarate reductase subunit C  74.62 
 
 
130 aa  207  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0380  fumarate reductase subunit C  73.08 
 
 
131 aa  202  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3838  fumarate reductase subunit C  71.32 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03986  hypothetical protein  71.32 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5670  fumarate reductase subunit C  71.32 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4684  fumarate reductase subunit C  71.32 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4623  fumarate reductase subunit C  71.32 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3858  fumarate reductase subunit C  71.32 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4711  fumarate reductase subunit C  71.32 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4396  fumarate reductase subunit C  71.32 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04024  fumarate reductase subunit C  71.32 
 
 
131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3938  fumarate reductase subunit C  73.08 
 
 
132 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3760  fumarate reductase subunit C  71.54 
 
 
132 aa  191  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0341  fumarate reductase subunit C  71.54 
 
 
131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4702  fumarate reductase subunit C  70.77 
 
 
131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4611  fumarate reductase subunit C  70.77 
 
 
131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368113  normal  0.646266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4619  fumarate reductase subunit C  70.77 
 
 
131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0469  fumarate reductase subunit C  70.77 
 
 
131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4759  fumarate reductase subunit C  70 
 
 
131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4738  fumarate reductase subunit C  70 
 
 
131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1279  fumarate reductase subunit C  45.38 
 
 
134 aa  127  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000508075  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00133  fumarate reductase subunit C  36.8 
 
 
127 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002235  fumarate reductase subunit C  36.8 
 
 
127 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2790  fumarate reductase subunit C  34.4 
 
 
127 aa  97.1  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2232  fumarate reductase subunit C  36.8 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3280  fumarate reductase, subunit C  42.73 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0352  fumarate reductase subunit C  37.38 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1448  fumarate reductase, 15 kDa hydrophobic protein  30.89 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1723  fumarate reductase, subunit C  26.19 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11586  fumarate reductase subunit C  30.25 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432879  normal  0.974077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>