26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0027 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0027  putative septation inhibitor protein  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  55.77 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000180482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  51.67 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  35.23 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  35.44 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  37.04 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  49.09 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  40.98 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27040  Uncharacterised protein family (UPF0233)  30.83 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.596682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  41.67 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  38.33 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000113441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  32.97 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  35.14 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0012  putative septation inhibitor protein  40.91 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.395634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0012  putative septation inhibitor protein  40.91 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0020  putative septation inhibitor protein  40.91 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0181383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  34.92 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00730  hypothetical protein  29.76 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0815  putative septation inhibitor protein  38.46 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144897  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0019  putative septation inhibitor protein  36.76 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  37.74 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0071  protein of unknown function UPF0233  43.64 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00160  hypothetical protein  27.27 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10011  putative septation inhibitor protein  35.38 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  26.87 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  26.74 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>