18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0660 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  996    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  58.22 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  55.51 
 
 		 505 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  44.66 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  45.53 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  45.44 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  37.23 
 
 		 510 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  50.82 
 
 		 376 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  30.33 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  26.57 
 
 		 565 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  22.53 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  22.55 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  20.79 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  22.35 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  21.58 
 
 		 558 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  21.07 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  20.32 
 
 		 555 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>