231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2652 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  100 
 
 
423 aa  803    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1381  glycosyltransferase, MGT family  49.76 
 
 
430 aa  330  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0109047  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2842  glycosyl transferase family protein  44.61 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142528  normal  0.0240997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  40 
 
 
429 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2103  glycosyltransferase family 28 protein  40.29 
 
 
427 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646286  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5223  glycosyl transferase family protein  34.28 
 
 
418 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0184372  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3984  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  36.36 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.387501  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2129  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  35.82 
 
 
387 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2175  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  35.82 
 
 
387 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271893  normal  0.342617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2116  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  35.82 
 
 
387 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0869037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3114  Glycosyl transferase-like UDP- glucuronosyltransferase  34.38 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.826951  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2248  protein of unknown function DUF1205  31.04 
 
 
370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1781  hypothetical protein  37.01 
 
 
380 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1905  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0466  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00234533  normal  0.19115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2401  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  33.9 
 
 
390 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12752  hypothetical protein  35 
 
 
388 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000472311  normal  0.0284049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
433 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3557  glycosyltransferase MGT family  30.53 
 
 
366 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2942  glycosyltransferase, MGT family  31.48 
 
 
426 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2966  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
408 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.67 
 
 
449 aa  90.5  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0976  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  32.69 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103188  hitchhiker  0.00108852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
436 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2200  Glycosyl transferase related to UDP- glucuronosyltransferase-like protein  32.98 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  34.23 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1269  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1286  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.540508  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1296  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.205066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3223  glycosyltransferase, MGT family  25.06 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4779  glycosyl transferase family 28  29.9 
 
 
418 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.514672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8226  hypothetical protein  26.96 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  32.54 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  26.01 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0705  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5029  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.153009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  21.8 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3283  glycosyltransferase, MGT family  26.81 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2594  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.53 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00128778  hitchhiker  0.000911966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3573  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3646  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  24.2 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  38.41 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4758  glycosyl transferase family 28  32.34 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  26.22 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1566  glycosyl transferase family protein  20.25 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.789406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  26.01 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3970  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  22.82 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00770108  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22760  glycosyltransferase, MGT family  25.92 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1105  glycosyltransferase, MGT family  24.43 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1806  macrolide glycosyltransferase  28.66 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3578  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2041  putative glycosyl transferase  29.69 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221622  normal  0.0364064 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_1174  predicted protein  27.21 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  35.59 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4408  glycosyltransferase, MGT family  33.86 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  20.54 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0796  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.32 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  37.76 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  22.85 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29850  glycosyltransferase, MGT family  29.22 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1002  glycosyltransferase family 28 protein  30.17 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.2 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  28.64 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11557  glycosyltransferase  32.34 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  31.09 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3785  macrolide glycosyltransferase-like  25.99 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  29.49 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3135  glycosyltransferase, MGT family  34.21 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215343 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.69 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.69 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0558  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.69 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.69 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.69 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.69 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.22 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.22 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.69 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.69 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.22 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  29.22 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.22 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3273  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0719433  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6241  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  26.33 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2034  hypothetical protein  29.06 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.906883  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.6 
 
 
475 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.6 
 
 
475 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5095  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509328  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2021  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  29.45 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4043  protein of unknown function DUF1205  28.46 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.392322  normal  0.322652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2111  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000775281  normal  0.550046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>