20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2130 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2130  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1836  hypothetical protein  54.59 
 
 
197 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301761  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2417  hypothetical protein  50 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3169  hypothetical protein  46.11 
 
 
198 aa  121  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18090  hypothetical protein  41.8 
 
 
244 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1703  hypothetical protein  41.92 
 
 
210 aa  112  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.338855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1401  hypothetical protein  35.35 
 
 
224 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.89013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1332  hypothetical protein  40 
 
 
221 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.386362  normal  0.4731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0301  hypothetical protein  35.16 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0142  hypothetical protein  35.16 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2093  hypothetical protein  44.68 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0050672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01170  hypothetical protein  38.94 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2029  hypothetical protein  39.53 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0861085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1413  hypothetical protein  28.81 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14690  MarR family regulator  39.13 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15490  SatD  27.13 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.163286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12070  hypothetical protein  50.85 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0543745  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0981  satD protein  23.56 
 
 
228 aa  45.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1008  hypothetical protein  25.62 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24060  hypothetical protein  34.78 
 
 
213 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.384658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>